本校校徽由東方科技學院美工科劉政雄老師設計，由一個枝幹盛托著象徵啟聰、啟明、啟智三個障礙類別的色塊，代表扶持這三類學生，整體看來像一棵大樹，象徵樹人。
主色調是海水藍，再搭配葡萄紫，而藍和紫剛好和「楠梓」諧音。
其設計理念如下： 校徽穩定與成長的結構象徵本校培育與教導的教育理念。 整體標誌由一個統一單元構成： 菱形的造形代表本校特殊教育啟智、啟聰、啟明三大教育重點； 中間圓形代表本校圓滿與祥和的教育方向，樹狀的造形則代表本校孕育與滲透特教之理念。 標準色藍色象徵本校穩定成長的教育，也表徵我們成熟穩重的教育方式。 紫色則象徵本校付出教育理念之熱忱，充滿了朝氣蓬勃的光明、希望與活力。
排除障礙 不畏艱辛雖乏先天 卻富後勁發揮潛力 不輸常人為楠為梓 操之在己奮勇向前 轉敗為勝
黃進家 ‧‧‧‧‧‧‧‧‧ 1筆黃水木 ‧‧‧‧‧‧‧‧‧ 1筆黃子服 ‧‧‧‧‧‧‧‧‧ 2筆鄭坤陸 ‧‧‧‧‧‧‧‧‧ 2筆邱王罔市 ‧‧‧‧‧‧‧‧ 8筆邱清風 ‧‧‧‧‧‧‧‧‧ 2筆邱圻明 ‧‧‧‧‧‧‧‧‧ 2筆邱圻勝 ‧‧‧‧‧‧‧‧‧ 2筆蔡炳量 ‧‧‧‧‧‧‧‧‧ 2筆王文治 ‧‧‧‧‧‧‧‧‧ 2筆楊清展 ‧‧‧‧‧‧‧‧‧ 1筆楊 彭 ‧‧‧‧‧‧‧‧‧‧ 2筆林東雄 ‧‧‧‧‧‧‧‧‧ 2筆林東連 ‧‧‧‧‧‧‧‧‧ 7筆林東生 ‧‧‧‧‧‧‧‧‧ 3筆李金元 ‧‧‧‧‧‧‧‧‧ 1筆張福連 ‧‧‧‧‧‧‧‧‧ 4筆張才王 ‧‧‧‧‧‧‧‧‧ 1筆張國和 ‧‧‧‧‧‧‧‧‧ 1筆劉振雄 ‧‧‧‧‧‧‧‧‧ 2筆張萬成 ‧‧‧‧‧‧‧‧‧ 1筆邱圻昕 ‧‧‧‧‧‧‧‧‧ 2筆
吳登有 ‧‧‧‧‧‧‧‧‧ 1筆陳朝印 ‧‧‧‧‧‧‧‧‧ 1筆尤葉忍 ‧‧‧‧‧‧‧‧‧ 2筆黃漏簡 ‧‧‧‧‧‧‧‧‧ 1筆黃 清 ‧‧‧‧‧‧‧‧‧‧ 1筆王候鏡 ‧‧‧‧‧‧‧‧‧ 3筆邱清風 ‧‧‧‧‧‧‧‧‧ 1筆劉龍男 ‧‧‧‧‧‧‧‧‧ 1筆鄭全安 ‧‧‧‧‧‧‧‧‧ 3筆王安心 ‧‧‧‧‧‧‧‧‧ 1筆王家和 ‧‧‧‧‧‧‧‧‧ 1筆李水來 ‧‧‧‧‧‧‧‧‧ 1筆張惠吉 ‧‧‧‧‧‧‧‧‧ 4筆馬水性 ‧‧‧‧‧‧‧‧‧ 1筆林飛雷 ‧‧‧‧‧‧‧‧‧ 2筆凌 上 ‧‧‧‧‧‧‧‧‧‧ 1筆邱 旺 ‧‧‧‧‧‧‧‧‧‧ 2筆邱清風 ‧‧‧‧‧‧‧‧‧ 3筆邱王罔市 ‧‧‧‧‧‧‧‧ 3筆陳李麗鳳 ‧‧‧‧‧‧‧‧ 2筆邱安五郎 ‧‧‧‧‧‧‧‧ 2筆